270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06805 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  58.37 
 
 
270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  54.44 
 
 
254 aa  286  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  36.82 
 
 
242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  36.97 
 
 
242 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  34.18 
 
 
242 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  34.69 
 
 
238 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  35.56 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  35.05 
 
 
222 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  31.2 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  31.2 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  33.18 
 
 
237 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  33.48 
 
 
222 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  33.48 
 
 
222 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  34.96 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  32.88 
 
 
244 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  37.21 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  32.21 
 
 
238 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  35.02 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.46 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  31.75 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.75 
 
 
238 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  33.66 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  30.1 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  35.21 
 
 
221 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  31.88 
 
 
223 aa  105  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  27.52 
 
 
243 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  29.46 
 
 
241 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.7 
 
 
226 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  32.08 
 
 
224 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  31.56 
 
 
237 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  27.14 
 
 
254 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.5 
 
 
238 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  29.67 
 
 
224 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  31.86 
 
 
247 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.76 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30.37 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  32.29 
 
 
227 aa  98.6  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  31.73 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.03 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.03 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  30.18 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  29.77 
 
 
232 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  26.82 
 
 
231 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  32.04 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  29.44 
 
 
223 aa  96.3  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  26.72 
 
 
235 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  30.24 
 
 
300 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  27.31 
 
 
232 aa  95.5  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  29.11 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  29.41 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  26.47 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  26.29 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.97 
 
 
234 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  27.12 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  27.88 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  28.7 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  38.64 
 
 
141 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.89 
 
 
235 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  27.12 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  29.34 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  25.86 
 
 
235 aa  92  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  26.47 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  26.47 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  26.47 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.11 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  26.72 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  27.86 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  25.4 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  28.63 
 
 
242 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  29.41 
 
 
316 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  30.62 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  26.47 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.92 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.31 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  25.97 
 
 
237 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  28.92 
 
 
303 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  29.44 
 
 
320 aa  89.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  29.52 
 
 
292 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  29.9 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.69 
 
 
240 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  33.49 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  26.29 
 
 
235 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  27.8 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  27.07 
 
 
233 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  28.84 
 
 
245 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  28.09 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.31 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1535  hypothetical protein  28.25 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.714061 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  29.11 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>