139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06284 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  714    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  76.9 
 
 		 352 aa  531  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  61.21 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  55.18 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  51.87 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  44.19 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  28.43 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  28.43 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  28.17 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  28.17 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  27.82 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  27.84 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  27.58 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  27.58 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  27.51 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  28.18 
 
 		 402 aa  95.9  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  27.1 
 
 		 402 aa  95.9  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  27.89 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  27.57 
 
 		 385 aa  92.8  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  28.99 
 
 		 403 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  28.99 
 
 		 403 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  28.4 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  28.4 
 
 		 403 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  26.8 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  26.85 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  26.49 
 
 		 389 aa  89.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  26.35 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  26.91 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  31.84 
 
 		 403 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  26.25 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  35.03 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  35.03 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  26.12 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  27.95 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  33.15 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  31.25 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  25.89 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  26.32 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  34.29 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  33.91 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  27.22 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  25.35 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  25.42 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  25.42 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  25.07 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  25.42 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  25.42 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  25 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  25.6 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  25.6 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  25.14 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  24.93 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  24.93 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  24.93 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  24.93 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  25.33 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  25.82 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  25.55 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  25.55 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  25.84 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  25.55 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  25.55 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  25.55 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  25.27 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  24.86 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  24.73 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  25.97 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1776  outer membrane protein N  25.42 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  24.66 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  26.78 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  27.22 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  25.84 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  25.28 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  25.28 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  25.84 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  24.73 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  25.9 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  28.31 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  24.27 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  22.6 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  25.34 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  24.44 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  25.34 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  25.34 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  26.42 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  26.42 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  26.42 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  23.91 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  24.86 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  24.52 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  24.52 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  24.52 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  24.52 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  23.91 
 
 		 357 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  24.52 
 
 		 377 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  26.54 
 
 		 363 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  24.24 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  29.61 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  29.38 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  26.88 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>