More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05667 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 108 aa  223  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  78.43 
 
 		 106 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  58.33 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  58.06 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  46.53 
 
 		 105 aa  85.9  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  46.53 
 
 		 105 aa  85.9  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  46.53 
 
 		 105 aa  85.9  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  44.21 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  42.71 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  42 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  41.75 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  41.51 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  39.6 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  50 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  50 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  40.59 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  43.21 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  39.53 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  41.49 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  37.5 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  36 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  45 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  36 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  36.79 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0009  monoheme cytochrome c  39.05 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00972927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0009  monoheme cytochrome c  39.05 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  37.37 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  40.2 
 
 		 211 aa  67  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  34 
 
 		 318 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0009  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  34.91 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  40 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.95 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  38.95 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  44.93 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  36.78 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  37.5 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0717  monoheme cytochrome c  41.94 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.95 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  34.91 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  32.99 
 
 		 196 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  40.4 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  42.42 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  38.55 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  44 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  35.29 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 206 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  38.55 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  35.64 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  33.64 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  35.64 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  35.64 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  39.53 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  38.03 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  38 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  36.63 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  40 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  38.37 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  36.23 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  42.39 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  32.32 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  39.6 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  41.3 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  33.33 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>