More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05419 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  83.25 
 
 		 191 aa  329  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  56.54 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  40.84 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  33.01 
 
 		 203 aa  96.7  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  33.33 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.21 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 305 aa  68.6  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  25.14 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.24 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  27.72 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  27.08 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  27.74 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  25.77 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  26.71 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  34.82 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  34.82 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  34.82 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  34.82 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  34.82 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  27.08 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  25 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  32.99 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  33.93 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.65 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  27.55 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.92 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.66 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  27.81 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  29.17 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  30.46 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  29.37 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.37 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  29.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  28.67 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.34 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 436 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.57 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  29.57 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  34.51 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 341 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.69 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  29.57 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.13 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  30.7 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  28.37 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 341 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.21 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.57 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  27.97 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  32.5 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.99 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  27.97 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  27.34 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  29.33 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.69 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  25.9 
 
 		 658 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.73 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  35.85 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  28.67 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.47 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>