More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00634 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  99.14 
 
 
116 aa  227  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  64.12 
 
 
133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.15 
 
 
136 aa  157  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  57.78 
 
 
135 aa  157  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  59.54 
 
 
132 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.82 
 
 
135 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.3 
 
 
136 aa  153  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  60.77 
 
 
133 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  56 
 
 
136 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 
134 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.44 
 
 
134 aa  150  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 
134 aa  148  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 
134 aa  147  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.24 
 
 
134 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 
134 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  57.25 
 
 
134 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 
134 aa  147  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 
134 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 
134 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 
134 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 
134 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 
134 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  51.13 
 
 
134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.38 
 
 
134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.49 
 
 
134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.15 
 
 
134 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  54.96 
 
 
134 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  55.73 
 
 
134 aa  141  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.65 
 
 
134 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  55.2 
 
 
134 aa  140  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  48.06 
 
 
136 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  42.54 
 
 
134 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
136 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.8 
 
 
135 aa  114  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  44.44 
 
 
143 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  42.75 
 
 
135 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.32 
 
 
137 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.32 
 
 
139 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.64 
 
 
133 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0162  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.96 
 
 
140 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.45 
 
 
134 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  36.36 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0871  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
135 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.64 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.11 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2484  putative TonB system transport protein ExbD2  41.67 
 
 
137 aa  94.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000778685  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  34.13 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.29 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  25.95 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.8 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  32.79 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.79 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  29.55 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.79 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  32.28 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  29.37 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  26.15 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  35.29 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  30.71 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.5 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  28.68 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3535  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.21 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0276674  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.73 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  29.32 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.73 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  27.42 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  30.77 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  28.93 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 
218 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3984  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357601  normal  0.130758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>