More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003937 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  100 
 
 		 263 aa  544  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  95.06 
 
 		 263 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  77.91 
 
 		 260 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  73.26 
 
 		 259 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  63.53 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  49.03 
 
 		 278 aa  268  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  47.66 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  48.06 
 
 		 261 aa  265  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  48.06 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  48.45 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  48.44 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  46.88 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  47.67 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  47.08 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  46.88 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  47.08 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  47.08 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  47.08 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  47.08 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  44.96 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  42.23 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  40.71 
 
 		 262 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  40.71 
 
 		 262 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  39.44 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  39.84 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  43.08 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  38.67 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  38.67 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  35.69 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  33.72 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  34.66 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  35.29 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  34.4 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  34.51 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  34 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  34 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  34.31 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  34 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  34 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  34 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  32.33 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  42.53 
 
 		 199 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  30.77 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  24.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  24.32 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  28.44 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  24.17 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  23.55 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  21.43 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  23.27 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  23.5 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  26.56 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.11 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  20.71 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.56 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.56 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.17 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  25.22 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.61 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.36 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.71 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.4 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.64 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.97 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.97 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.67 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.66 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.41 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.11 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 330 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>