More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002441 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  100 
 
 		 417 aa  863    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03619  hypothetical protein  88.73 
 
 		 416 aa  769    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  72.42 
 
 		 417 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  46.19 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  44.47 
 
 		 419 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  43.34 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  43 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  42.51 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  42.51 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  42.51 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  41.2 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  42.36 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 		 448 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1533  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1740  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0020457  hitchhiker  0.000000139322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  29.72 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  32.37 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2844  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 401 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2785  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.576348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2677  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0495903  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1707  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.336199  hitchhiker  0.00000000228232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2756  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2512  hypothetical protein  29.85 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2944  metal dependent phosphohydrolase  30.02 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 439 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 401 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  26.47 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  27.43 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  26.49 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  26.52 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 353 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.55 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 436 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  25.75 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  26.63 
 
 		 394 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  25.96 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  27.55 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  24.33 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 		 448 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  25.94 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 396 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>