More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1517 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  56.22 
 
 		 185 aa  217  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  216  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  214  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  53.8 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 173 aa  201  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  200  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  52.78 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3579  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1164  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  48.62 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0574  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.165551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  48.07 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  52.3 
 
 		 174 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  50.55 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 181 aa  184  9e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0788  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  45.41 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  45.36 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  44.86 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  46.02 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  44.32 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  46.2 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  43.24 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  48.33 
 
 		 187 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  45.95 
 
 		 185 aa  180  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>