More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0998 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  48.54 
 
 
717 aa  686  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.42 
 
 
716 aa  660  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06243e-06 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  46.56 
 
 
727 aa  681  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.74 
 
 
732 aa  707  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.52 
 
 
726 aa  681  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.67155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.57 
 
 
820 aa  640  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.1 
 
 
717 aa  642  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.77 
 
 
716 aa  695  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.55141e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.35 
 
 
726 aa  662  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.75 
 
 
724 aa  667  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.66061e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1459  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.1 
 
 
743 aa  640  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2653  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.19 
 
 
750 aa  656  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0939  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.92 
 
 
732 aa  698  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.61 
 
 
710 aa  680  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.64 
 
 
733 aa  669  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2287  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.72 
 
 
727 aa  659  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421652  hitchhiker  1.20051e-07 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.71 
 
 
725 aa  679  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2720  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.25 
 
 
802 aa  659  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865135  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.01 
 
 
742 aa  659  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  44.83 
 
 
726 aa  650  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  44.28 
 
 
726 aa  645  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2530  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.43 
 
 
789 aa  657  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471952  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.84 
 
 
726 aa  659  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.84 
 
 
727 aa  663  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.35 
 
 
716 aa  659  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.01 
 
 
727 aa  676  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1311  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.03 
 
 
738 aa  637  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.03 
 
 
716 aa  651  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  50.71 
 
 
771 aa  698  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.64 
 
 
729 aa  649  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0901  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.78 
 
 
712 aa  663  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0988529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.28 
 
 
727 aa  679  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  45.62 
 
 
729 aa  660  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4122  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.79 
 
 
774 aa  689  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.04 
 
 
721 aa  692  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78164e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  46.56 
 
 
727 aa  681  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.80159e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  46.42 
 
 
727 aa  679  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4829  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.93 
 
 
749 aa  651  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401142 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.61 
 
 
728 aa  717  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1433  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.1 
 
 
743 aa  640  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  46.42 
 
 
727 aa  679  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.74 
 
 
716 aa  674  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.34468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  45.62 
 
 
729 aa  660  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  47.88 
 
 
751 aa  650  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4989  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.88 
 
 
751 aa  645  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  45.53 
 
 
786 aa  635  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  49.44 
 
 
728 aa  730  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  49.03 
 
 
728 aa  725  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  46.83 
 
 
727 aa  684  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  45.77 
 
 
716 aa  656  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3171  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.47 
 
 
861 aa  640  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  45.77 
 
 
716 aa  661  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.3827e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.9 
 
 
714 aa  647  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  46.92 
 
 
814 aa  642  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  46.42 
 
 
727 aa  681  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  45.47 
 
 
734 aa  653  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1377  metal dependent phosphohydrolase  45.62 
 
 
779 aa  646  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.790837  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  46.42 
 
 
727 aa  681  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  100 
 
 
721 aa  1483  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4151  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  46.69 
 
 
727 aa  684  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4140  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  46.56 
 
 
727 aa  681  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.62 
 
 
790 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  45.14 
 
 
812 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.37 
 
 
766 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.03 
 
 
806 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.48 
 
 
827 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  7.28185e-06 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3380  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.68 
 
 
822 aa  633  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200325  hitchhiker  0.00033219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.03 
 
 
801 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  44.17 
 
 
856 aa  631  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.66 
 
 
788 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1945  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.77 
 
 
779 aa  630  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.712963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.28 
 
 
804 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.03 
 
 
801 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  45.06 
 
 
815 aa  628  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.16 
 
 
793 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1673  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.75 
 
 
781 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  45.79 
 
 
790 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.42988e-06  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1196  GTP pyrophosphokinase  43.79 
 
 
729 aa  628  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0487271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6106  GTP diphosphokinase  44.92 
 
 
785 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.364718  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3042  (p)ppGpp synthetase I  43.57 
 
 
758 aa  624  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2308  RelA/SpoT family protein  45.25 
 
 
790 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0636363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2572  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.18 
 
 
748 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1801  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.34 
 
 
795 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.203828  normal  0.0273265 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0520  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.66 
 
 
781 aa  618  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0839645  hitchhiker  6.97847e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.15 
 
 
746 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.15 
 
 
746 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  43.72 
 
 
789 aa  615  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1569  metal dependent phosphohydrolase  43.04 
 
 
715 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.44 
 
 
813 aa  618  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.15 
 
 
746 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17580  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  45.28 
 
 
775 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.091974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.46 
 
 
746 aa  612  1e-174  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.17 
 
 
745 aa  613  1e-174  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.59955e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.43 
 
 
746 aa  613  1e-174  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  44.49 
 
 
809 aa  613  1e-174  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.698973  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1999  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.46 
 
 
790 aa  614  1e-174  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.062239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2297  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.34 
 
 
797 aa  615  1e-174  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.46 
 
 
746 aa  613  1e-174  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0842  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.77 
 
 
817 aa  615  1e-174  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461248  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.1 
 
 
735 aa  615  1e-174  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00537939  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>