More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0330 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0330  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  495  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00533826 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0182  ABC transporter related  96.86 
 
 
255 aa  478  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.356361  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2842  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0253  ABC transporter related  62.64 
 
 
99 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0572111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  35.53 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  35.75 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.35 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6603  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  31.44 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  31.44 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0784  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.217947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  31.31 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1561  ABC transporter related  30.81 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  31.82 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  35.18 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  32.31 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  36.9 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  32.57 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  32.57 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  32.72 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  35.86 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 
274 aa  79  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0116  ABC transporter-related protein  29.13 
 
 
241 aa  79  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  29.91 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  35.68 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  32.83 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  31.53 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1180  ABC transporter related  29.26 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  31.31 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  34.91 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0639  ABC transporter related  31.44 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3013  ABC transporter related  30.57 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1839  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  30.28 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0189  ABC transporter related  31.44 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  27.38 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  29.95 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0672  ABC transporter related  31.44 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  35.9 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  34.38 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  27.71 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2923  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  30.57 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.524102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  32.02 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  30.81 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  29.49 
 
 
241 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1564  ABC transporter related  32.34 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239809  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1406  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
376 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515015  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  35.57 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  36.63 
 
 
342 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  37.36 
 
 
383 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  31.98 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  29.95 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  32.99 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  29.41 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  30.81 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  31.82 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3758  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  31 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.26 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  34.34 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  31.82 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3333  ABC transporter related  33.16 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  32.35 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2434  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.967343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1208  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3393  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2711  ABC transporter related  32.83 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  30.46 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  31.89 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3428  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.901606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0347  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2619  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  33.33 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  31.37 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  30.3 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  28.24 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.09 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0679  ABC transporter related  27.75 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  29.26 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  33.67 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  29.26 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  31.31 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  30.81 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0655  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0688  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000562177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>