46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0034 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
160 aa  311  2e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  72.05 
 
 
161 aa  225  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  67.7 
 
 
161 aa  214  3e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  69.57 
 
 
161 aa  214  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  43.6 
 
 
182 aa  134  7e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 
165 aa  107  8e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  46.81 
 
 
134 aa  103  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
165 aa  81.3  6e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 
170 aa  80.1  1e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 
164 aa  75.5  3e-13  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  32.72 
 
 
163 aa  71.6  4e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 
178 aa  70.5  8e-12  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  29.09 
 
 
162 aa  70.5  9e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 
159 aa  69.3  2e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  34.36 
 
 
162 aa  69.3  2e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  29.01 
 
 
158 aa  67  1e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 
158 aa  66.6  1e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 
172 aa  66.2  2e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 
181 aa  61.2  6e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.38 
 
 
159 aa  53.1  1e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 
177 aa  53.5  1e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  23.84 
 
 
173 aa  52.8  2e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  26.79 
 
 
177 aa  48.5  4e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0775  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 
622 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.79131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2926  Fis family transcriptional regulator  41.43 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  normal  0.125952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 
279 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2878  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 
235 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
185 aa  44.7  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
76 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
192 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
371 aa  44.3  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.12762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  48.98 
 
 
69 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.9797e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 
213 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1317  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 
106 aa  40.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  8.65545e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  36.51 
 
 
209 aa  40.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 
64 aa  40.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
209 aa  40.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90673e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>