76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3796 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
478 aa  949    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  42.24 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  42.24 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  40 
 
 
488 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  39.65 
 
 
473 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  34.33 
 
 
488 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  33.48 
 
 
488 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  33.48 
 
 
488 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  33.48 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  33.48 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  33.48 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  33.48 
 
 
484 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  33.48 
 
 
484 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 
492 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  33.75 
 
 
488 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  34.05 
 
 
488 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 
488 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 
488 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 
488 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 
488 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  33.05 
 
 
498 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 
488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  33.55 
 
 
488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  31.64 
 
 
486 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  32.46 
 
 
429 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 
424 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  31.86 
 
 
422 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  29.37 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 
419 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  28.71 
 
 
468 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
504 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.76 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 
507 aa  70.5  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
448 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 
520 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  21.93 
 
 
506 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  21.91 
 
 
511 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  20.4 
 
 
501 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
497 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  21.41 
 
 
496 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
492 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 
499 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 
489 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  22.65 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.76 
 
 
504 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
468 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 
448 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 
461 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
442 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 
489 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 
499 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 
494 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
486 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 
488 aa  46.6  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2595  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
452 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  19.71 
 
 
514 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  28.21 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.2 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 
517 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  18.95 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 
500 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
512 aa  43.9  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 
500 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 
458 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  28.48 
 
 
359 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
541 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  19.47 
 
 
489 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  24.09 
 
 
516 aa  43.5  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>