More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0056 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  77.27 
 
 		 462 aa  729    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  71.37 
 
 		 465 aa  669    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 462 aa  943    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  77.71 
 
 		 462 aa  733    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  51.84 
 
 		 461 aa  471  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  51.41 
 
 		 461 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.72 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.91 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.61 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  45.92 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.66 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  45.67 
 
 		 474 aa  392  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  40.96 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.43 
 
 		 483 aa  345  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.34 
 
 		 476 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.55 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 		 497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.1 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.7 
 
 		 464 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.61 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  39.15 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.89 
 
 		 470 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.54 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.07 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  39.43 
 
 		 460 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.39 
 
 		 480 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  38.68 
 
 		 481 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  38.56 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.13 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  38.23 
 
 		 484 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  38.49 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.49 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  38.49 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  38.49 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  38.49 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  38.49 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  38.49 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  38.09 
 
 		 475 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  35.79 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  38.49 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  36.77 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  38.05 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.09 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  38.26 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.26 
 
 		 479 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  38.76 
 
 		 480 aa  299  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.26 
 
 		 479 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  38.76 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  38.74 
 
 		 490 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.04 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  38.28 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  37.45 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  37.87 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  38.82 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.42 
 
 		 474 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.03 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.78 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  39.18 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.12 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.42 
 
 		 474 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  37.18 
 
 		 481 aa  292  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  38.38 
 
 		 490 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  37.39 
 
 		 482 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.7 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.27 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.13 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.97 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.61 
 
 		 486 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.97 
 
 		 488 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.92 
 
 		 488 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  39.33 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  36.42 
 
 		 486 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  37.92 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  36.97 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  37.42 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  36.97 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  36.97 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  35.9 
 
 		 481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  36.97 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  36.97 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.64 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.41 
 
 		 508 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  36.97 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  36.03 
 
 		 483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  36.97 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.3 
 
 		 469 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  36.19 
 
 		 481 aa  290  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  37.9 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.37 
 
 		 488 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  37.21 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.18 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.52 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0255  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.15 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.15 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  36.56 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.36 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  37.21 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  38.67 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>