More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0775 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
583 aa  1174    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  47.7 
 
 
584 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  47.77 
 
 
553 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  47.42 
 
 
551 aa  482  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  47.14 
 
 
582 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  45.45 
 
 
601 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 
591 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  47.43 
 
 
570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 
587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  46.55 
 
 
590 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  47.98 
 
 
602 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 
574 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
571 aa  350  5e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
578 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
565 aa  302  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 
569 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 
555 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 
570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.05 
 
 
644 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.24 
 
 
516 aa  269  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.17 
 
 
529 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.69 
 
 
500 aa  264  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 
506 aa  263  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
527 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
539 aa  260  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
536 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
506 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 
518 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
523 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
523 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 
525 aa  256  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
517 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 
501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 
509 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
521 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
518 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 
563 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 
508 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 
544 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 
500 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 
511 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 
502 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 
521 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
520 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
523 aa  249  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
512 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
519 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 
509 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
499 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 
579 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
530 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
522 aa  247  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 
520 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 
514 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
525 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
555 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 
514 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 
559 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.39 
 
 
592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 
507 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 
531 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 
526 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 
515 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  36.9 
 
 
532 aa  243  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 
506 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
500 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
549 aa  242  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.42 
 
 
570 aa  242  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 
520 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 
534 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 
513 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  32.36 
 
 
552 aa  241  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.85 
 
 
515 aa  240  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
499 aa  240  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
549 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 
570 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
525 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.75 
 
 
568 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 
557 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.18 
 
 
556 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.18 
 
 
556 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.18 
 
 
556 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.3 
 
 
552 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 
495 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
505 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
558 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 
576 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 
570 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 
574 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 
510 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.62 
 
 
522 aa  237  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  32.12 
 
 
544 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 
516 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 
540 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 
540 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  31.72 
 
 
539 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
577 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 
554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>