132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1277 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
177 aa  348  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.65 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.93 
 
 
172 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  40.37 
 
 
166 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.53 
 
 
178 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.73 
 
 
174 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  37.95 
 
 
168 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  37.66 
 
 
167 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.44 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  36.55 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.93 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  38.41 
 
 
156 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.93 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.52 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 
169 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.52 
 
 
173 aa  94.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.94 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.21 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.25 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  36.25 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35 
 
 
175 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.62 
 
 
165 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.62 
 
 
165 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.62 
 
 
175 aa  91.3  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 
178 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.62 
 
 
165 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.9 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.76 
 
 
174 aa  89  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.09 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  35.25 
 
 
177 aa  87.8  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.33 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0666  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.57 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  33.33 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  36.62 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  34.29 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  34.29 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  34.29 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  34.29 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  34.29 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  34.29 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  34.29 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.53 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  34.29 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0060  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.92 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.41 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  35 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.05 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  28.48 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  28.48 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.85 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.85 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.85 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.49 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.85 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3819  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.99 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.8 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.56 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.04 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.79 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.79 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.79 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.49 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.93 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.21 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  25.93 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.93 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.14 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  28.24 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.55 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  29.08 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  28.24 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  26.58 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.17 
 
 
166 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  27.33 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  27.15 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.7 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.28 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.87 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  27.59 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  27.59 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.99 
 
 
214 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.84 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.14 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.1 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38900  Outer membrane chaperone Skp  27.88 
 
 
167 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  28.92 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.24 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  27.54 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  27.54 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  27.54 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  26.43 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  24.54 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  24.09 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.48 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  24.38 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2539  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.16 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  26.9 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  26.9 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>