More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0960 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  74.62 
 
 		 129 aa  194  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  63.49 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  61.6 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  56.8 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  60.77 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  58.47 
 
 		 123 aa  143  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  60.47 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  59.06 
 
 		 128 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  57.03 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  55.47 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  56.15 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  58.06 
 
 		 123 aa  137  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  58.2 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  57.38 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  53.23 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  55.04 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  52.31 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  57.94 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  51.54 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  48.09 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  53.28 
 
 		 126 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  45.86 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  51.54 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.84 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  53.97 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  47.62 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  49.62 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  52.67 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  50.77 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  51.28 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  50.77 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  50.77 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  50.77 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  46.83 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  54.4 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  46.83 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  54.81 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  52.03 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  44.96 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  48.41 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.41 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.04 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>