More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0952 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  100 
 
 
408 aa  817    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  63.06 
 
 
384 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  54.82 
 
 
410 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  47.13 
 
 
447 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  47.44 
 
 
417 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 
420 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
420 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  42.89 
 
 
405 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  44.22 
 
 
423 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  44.5 
 
 
439 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  44.13 
 
 
395 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 
445 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  45.07 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.8 
 
 
407 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  42.32 
 
 
399 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  38.57 
 
 
422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  39.58 
 
 
397 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  42 
 
 
372 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  43.78 
 
 
428 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  41.31 
 
 
400 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
398 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
439 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  40.94 
 
 
394 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  36.16 
 
 
430 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  46.01 
 
 
443 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  42.62 
 
 
372 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  42.6 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.36 
 
 
392 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
441 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.44 
 
 
438 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
405 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  36.71 
 
 
392 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
394 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  36.19 
 
 
421 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  40.07 
 
 
478 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
392 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
403 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  41.79 
 
 
399 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.51 
 
 
442 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  38.35 
 
 
433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.71 
 
 
408 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  38 
 
 
424 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  45.8 
 
 
432 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
424 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.43 
 
 
442 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.78 
 
 
443 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.31 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  39.14 
 
 
384 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.25 
 
 
430 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  38.31 
 
 
395 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  36.52 
 
 
393 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44 
 
 
406 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.56 
 
 
381 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  34.58 
 
 
385 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.96 
 
 
402 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.58 
 
 
430 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.55 
 
 
378 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.46 
 
 
383 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.02 
 
 
400 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  44.9 
 
 
470 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.21 
 
 
370 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  35.29 
 
 
393 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  46.83 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.93 
 
 
369 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  47.56 
 
 
419 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  36.78 
 
 
372 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  41.73 
 
 
388 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
869 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
469 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  33.25 
 
 
380 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  34.63 
 
 
449 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
470 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  36.04 
 
 
428 aa  160  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  34.59 
 
 
384 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.52 
 
 
408 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.91 
 
 
415 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0325  putative two-component system sensor kinase  40.12 
 
 
392 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
416 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
387 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
503 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
445 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
496 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  41.27 
 
 
426 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
413 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  35.7 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  41.6 
 
 
414 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
398 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
500 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
444 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  35.75 
 
 
413 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
379 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  38.68 
 
 
420 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
484 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.05 
 
 
370 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
421 aa  149  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.55 
 
 
271 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>