More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0558 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  100 
 
 
295 aa  587  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  43.61 
 
 
313 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  42.81 
 
 
306 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.62 
 
 
302 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.82 
 
 
309 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.82 
 
 
309 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  42.71 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  44.52 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  43.45 
 
 
295 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  41.36 
 
 
297 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  37.25 
 
 
304 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  46.05 
 
 
302 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  44.19 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  43.4 
 
 
295 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.28 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  42.28 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  40.74 
 
 
299 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.27 
 
 
315 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.16 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  42.28 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  42.28 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  42.91 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  42.28 
 
 
311 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  41.33 
 
 
308 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.14 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  38.33 
 
 
309 aa  195  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  42.09 
 
 
302 aa  195  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  42.86 
 
 
312 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  41.64 
 
 
308 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  41 
 
 
308 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  41.28 
 
 
302 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.86 
 
 
305 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  41.55 
 
 
305 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  40.98 
 
 
308 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.93 
 
 
302 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  35.15 
 
 
306 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  42 
 
 
309 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  39.26 
 
 
302 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  43.96 
 
 
304 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  36.46 
 
 
290 aa  189  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.74 
 
 
303 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  39.06 
 
 
298 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  40.2 
 
 
309 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  39.38 
 
 
298 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  42.03 
 
 
300 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.25 
 
 
305 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  43.67 
 
 
308 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  43.67 
 
 
308 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  44 
 
 
308 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  39.38 
 
 
298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  38.46 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  35.79 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  38.36 
 
 
298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  38.46 
 
 
308 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  38.36 
 
 
298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  35.18 
 
 
311 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  38.36 
 
 
298 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  38.36 
 
 
298 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  38.36 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  38.72 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  38.36 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  39.8 
 
 
297 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  38.01 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  38.7 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  41.39 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  35.69 
 
 
307 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  34.24 
 
 
303 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  34.67 
 
 
305 aa  175  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  35.23 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  38.59 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  35.23 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  35.43 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  37.25 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  37.25 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.25 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  40.75 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  37.71 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  38.41 
 
 
303 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33.33 
 
 
340 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  38.41 
 
 
303 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  38.44 
 
 
299 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  33.11 
 
 
310 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  41.58 
 
 
295 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  37.62 
 
 
303 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  38.61 
 
 
303 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  32.78 
 
 
310 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  37.46 
 
 
308 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  40.41 
 
 
310 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  37.92 
 
 
321 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  38.61 
 
 
303 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  33 
 
 
307 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  39.13 
 
 
296 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  36.88 
 
 
303 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  36.88 
 
 
303 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  43 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.77 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  33.99 
 
 
307 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  35.29 
 
 
317 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  36.21 
 
 
301 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  37.12 
 
 
310 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>