71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1821 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  100 
 
 
450 aa  910    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  35.49 
 
 
458 aa  266  5.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  34.9 
 
 
474 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  33.19 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  32.07 
 
 
460 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  33.19 
 
 
464 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  33.48 
 
 
463 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  32.68 
 
 
462 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  32.58 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  35.49 
 
 
461 aa  236  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  35.54 
 
 
457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  31.28 
 
 
473 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  34.67 
 
 
469 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  32.87 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  31.32 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  31.17 
 
 
460 aa  220  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  33.33 
 
 
457 aa  216  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  31.4 
 
 
463 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  32.23 
 
 
456 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  29.67 
 
 
496 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  35.21 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  32.93 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  32.96 
 
 
431 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  33.77 
 
 
420 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  33.08 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  30.29 
 
 
456 aa  177  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  30.98 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  30.24 
 
 
439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  30.88 
 
 
463 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  27.54 
 
 
471 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  29.18 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  31.16 
 
 
439 aa  161  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  27.39 
 
 
456 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  25.81 
 
 
469 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  26.42 
 
 
472 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  29.7 
 
 
476 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  28.71 
 
 
472 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  27.92 
 
 
475 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  28.07 
 
 
498 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  24.76 
 
 
487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  25.57 
 
 
472 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  25.97 
 
 
470 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.13 
 
 
509 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  26.17 
 
 
454 aa  104  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  24.33 
 
 
480 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  25.63 
 
 
407 aa  100  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.51 
 
 
474 aa  93.6  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  27.84 
 
 
485 aa  89.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  22.19 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  34.62 
 
 
292 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  33.85 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  29.08 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  32.92 
 
 
279 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  33.08 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  33.54 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  35.48 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  27.56 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  30.71 
 
 
261 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  25.7 
 
 
304 aa  53.9  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1207  ATPase  26.4 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  25.57 
 
 
304 aa  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  32.41 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  27.76 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1933  ATPase  25.22 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0359991  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0496  hypothetical protein  29.14 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  26.51 
 
 
365 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1105  hypothetical protein  29.94 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  29.28 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  25.12 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  25.26 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  28.25 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>