46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1177 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1177  ATPase  100 
 
 
407 aa  807    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  67.67 
 
 
454 aa  535  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  33 
 
 
476 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  29.07 
 
 
456 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  28.46 
 
 
478 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  27.39 
 
 
456 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  29.22 
 
 
456 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  27.45 
 
 
471 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  30.34 
 
 
443 aa  113  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  29.3 
 
 
462 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  26.84 
 
 
463 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  27 
 
 
460 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  24.04 
 
 
463 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  23.58 
 
 
462 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  25.63 
 
 
450 aa  100  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  25.84 
 
 
463 aa  99.8  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  27.94 
 
 
496 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  27.56 
 
 
474 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  25.94 
 
 
464 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  26.43 
 
 
470 aa  96.7  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  24.92 
 
 
457 aa  96.3  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  27.95 
 
 
456 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  26.52 
 
 
461 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  27.08 
 
 
473 aa  92.8  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  26.2 
 
 
458 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  25.52 
 
 
454 aa  90.5  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  30.99 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  26.9 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  26.06 
 
 
464 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  21.8 
 
 
469 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  22.77 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  23.91 
 
 
460 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  25.98 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  25.33 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  25.88 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  30.33 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  27.89 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  28.24 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  31.61 
 
 
498 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  26.8 
 
 
501 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  23.46 
 
 
472 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  27.51 
 
 
472 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  24.84 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.19 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  30.85 
 
 
509 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  26.2 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>