37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0500 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  72.2 
 
 
277 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  48.38 
 
 
307 aa  258  1e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  49.62 
 
 
261 aa  250  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  36.46 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  38.61 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  37.84 
 
 
292 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  37.74 
 
 
273 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  36.58 
 
 
313 aa  126  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  27.43 
 
 
304 aa  89.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  26.86 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  32.92 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  26.92 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  29.71 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  27.27 
 
 
460 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.91 
 
 
464 aa  65.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  33.09 
 
 
457 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  28.49 
 
 
458 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  27.17 
 
 
431 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  26.53 
 
 
462 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  28.31 
 
 
461 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  28.4 
 
 
464 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  25.54 
 
 
456 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  27.1 
 
 
463 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  25.98 
 
 
460 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  26.74 
 
 
462 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  26.95 
 
 
472 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  30.83 
 
 
472 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  24.68 
 
 
474 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  28.04 
 
 
469 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  26.6 
 
 
456 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  23.16 
 
 
463 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  22.47 
 
 
471 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  23.44 
 
 
469 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  25.71 
 
 
463 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  30.19 
 
 
420 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  25.9 
 
 
454 aa  42.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>