36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0397 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  100 
 
 
277 aa  548  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  72.2 
 
 
279 aa  412  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  48.19 
 
 
307 aa  248  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  48.22 
 
 
261 aa  239  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  40.79 
 
 
283 aa  185  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  38.22 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  37.84 
 
 
292 aa  171  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  38.82 
 
 
273 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  32.42 
 
 
313 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  29.02 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  27.95 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  33.54 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  27.01 
 
 
470 aa  68.9  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  29.93 
 
 
458 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  22.61 
 
 
462 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  34.92 
 
 
457 aa  63.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  29.11 
 
 
461 aa  62.4  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  27.69 
 
 
463 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  27.39 
 
 
474 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  32.88 
 
 
431 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  27.52 
 
 
462 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  26.63 
 
 
456 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  26.85 
 
 
464 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  26.44 
 
 
460 aa  55.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.27 
 
 
464 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  32.26 
 
 
420 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  28.82 
 
 
456 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  24.68 
 
 
472 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  26.42 
 
 
469 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  27.86 
 
 
472 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  25.81 
 
 
439 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  25.86 
 
 
469 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  26.45 
 
 
439 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  24.14 
 
 
463 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  25 
 
 
471 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  26.27 
 
 
478 aa  42  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>