56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1424 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1424  ATPase  100 
 
 
472 aa  936    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  57.42 
 
 
472 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  50.84 
 
 
475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  47.03 
 
 
470 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  48.41 
 
 
472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  36.7 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  28.92 
 
 
469 aa  151  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  26.29 
 
 
462 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  30.39 
 
 
464 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  30.82 
 
 
463 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  29.32 
 
 
464 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  28.64 
 
 
460 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  24.5 
 
 
457 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  26.42 
 
 
450 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  30.32 
 
 
474 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  28.86 
 
 
460 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.91 
 
 
463 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  29.38 
 
 
469 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  31.16 
 
 
458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  26.11 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  25.64 
 
 
461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  27.35 
 
 
470 aa  129  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  30.09 
 
 
456 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  27.98 
 
 
431 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  27.1 
 
 
463 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  27.38 
 
 
473 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  25.76 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  26.48 
 
 
454 aa  120  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  29.61 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0841  hypothetical protein  57.89 
 
 
101 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  30.11 
 
 
487 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  29.87 
 
 
439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  32.08 
 
 
443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  27.12 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  26.68 
 
 
471 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  26.81 
 
 
464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  27.44 
 
 
478 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  24.88 
 
 
496 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  27.68 
 
 
457 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  23.83 
 
 
456 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  22.2 
 
 
456 aa  94.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  23.65 
 
 
456 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  25.54 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  26.83 
 
 
498 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  23.59 
 
 
485 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.21 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  26.82 
 
 
454 aa  65.1  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.09 
 
 
509 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  29.9 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  26.95 
 
 
279 aa  54.7  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  23.92 
 
 
501 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  24.68 
 
 
277 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  22.16 
 
 
261 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  23.5 
 
 
313 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  21.92 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5448  hypothetical protein  41.18 
 
 
132 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>