63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2436 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  76.96 
 
 
464 aa  732    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  100 
 
 
460 aa  944    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  78.51 
 
 
463 aa  740    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  44.09 
 
 
458 aa  342  8e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  40.91 
 
 
460 aa  339  8e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  38.29 
 
 
461 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  40.17 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  38.43 
 
 
462 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  39.86 
 
 
464 aa  300  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  39.6 
 
 
474 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  37.89 
 
 
464 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  34.9 
 
 
463 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  36.73 
 
 
463 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  37.03 
 
 
469 aa  286  8e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  36.8 
 
 
470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  37.75 
 
 
496 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  35.32 
 
 
471 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  35.11 
 
 
469 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  37.05 
 
 
457 aa  258  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  35.56 
 
 
473 aa  257  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  32.07 
 
 
450 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  32.81 
 
 
457 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  31.18 
 
 
454 aa  231  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  40.36 
 
 
443 aa  229  6e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  36.17 
 
 
431 aa  227  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  32.82 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  31.22 
 
 
456 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  32.03 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  32.38 
 
 
439 aa  193  7e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  32.84 
 
 
439 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  30.45 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  27.72 
 
 
456 aa  170  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  28.67 
 
 
456 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  29.02 
 
 
456 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  28.27 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  31.13 
 
 
487 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  28.64 
 
 
472 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  30.57 
 
 
475 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  27.99 
 
 
472 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  31.66 
 
 
498 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  27.32 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  26.01 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  28.48 
 
 
501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  27.23 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  28.85 
 
 
480 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  27.88 
 
 
485 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.03 
 
 
474 aa  96.3  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  27.83 
 
 
454 aa  95.5  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  23.91 
 
 
407 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  25.68 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  25.44 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  23.24 
 
 
304 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  27.27 
 
 
279 aa  67  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  24.73 
 
 
307 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  25.81 
 
 
261 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  24.58 
 
 
283 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  36.62 
 
 
105 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  26.44 
 
 
277 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1968  hypothetical protein  32.58 
 
 
98 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.249157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  23.88 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1486  ATPase  24.64 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.659076  normal  0.220459 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  26.13 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  23.88 
 
 
365 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>