46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4522 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4522  ATPase  100 
 
 		 480 aa  956    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  36.08 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  36.7 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  36.71 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  34.42 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  33.26 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  26.5 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  28.85 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  27.67 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  21.48 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  24.77 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  24.33 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  26.46 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  25.96 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  27.68 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  26.39 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  27.32 
 
 		 469 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  22.86 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  24.94 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  27.57 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  25.73 
 
 		 471 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  25.06 
 
 		 496 aa  93.6  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  24.9 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  24.45 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  24.54 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  24.88 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  23.43 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  21.43 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  24.3 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  21.63 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  21.35 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  23.61 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  19.71 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.44 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  22.96 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  25.5 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  19.87 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  24.19 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  24.03 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  24.67 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.81 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  25.85 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  27.63 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  18.55 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.46 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  23.81 
 
 		 313 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>