47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0310 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  100 
 
 
472 aa  920    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  48.94 
 
 
475 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  47.77 
 
 
472 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  48.41 
 
 
472 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  47.7 
 
 
470 aa  349  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  36.08 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  28.29 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  27.47 
 
 
460 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  25.96 
 
 
450 aa  124  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  28.81 
 
 
464 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  29.01 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.22 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  24.81 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  29.31 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  25.98 
 
 
464 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  30.72 
 
 
487 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  27.81 
 
 
456 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  24.89 
 
 
462 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  26.5 
 
 
454 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  29.29 
 
 
463 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  26.86 
 
 
462 aa  104  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  25.16 
 
 
478 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  28.31 
 
 
457 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  24.72 
 
 
461 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  28.04 
 
 
474 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  24.57 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  26.3 
 
 
460 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  25.17 
 
 
496 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  24.44 
 
 
463 aa  93.6  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  27.42 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  26.16 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  24.28 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  26.52 
 
 
458 aa  87  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  25.76 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  21.73 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  25.6 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  21.09 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  26.62 
 
 
439 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.01 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  24.2 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  22.82 
 
 
485 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  28.71 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  29.55 
 
 
498 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  23.83 
 
 
304 aa  58.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  27.51 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0841  hypothetical protein  35.87 
 
 
101 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  22.44 
 
 
304 aa  47  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>