52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1281 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  948    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  52.84 
 
 		 472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  50.84 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  48.94 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  45.65 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  34.83 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  30.57 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  28.37 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  29.2 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  30.99 
 
 		 463 aa  136  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  26.77 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  31.28 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  29.45 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  27.92 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  28.73 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  28.66 
 
 		 460 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  27.34 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  26.96 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  25.66 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  28.95 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  26.73 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  25.11 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  27.79 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  26.9 
 
 		 473 aa  113  9e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  24.51 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  26.5 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  25.81 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  26.88 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  29.47 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  29.01 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  28.72 
 
 		 456 aa  103  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  27.45 
 
 		 478 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  25.68 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  28.9 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  25.2 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  25.21 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0841  hypothetical protein  49.46 
 
 		 101 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  26.38 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  37.43 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  25.9 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.08 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  20.67 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  22.46 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  23.31 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5448  hypothetical protein  46.84 
 
 		 132 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  27.17 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.11 
 
 		 509 aa  50.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  24.56 
 
 		 407 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  26.62 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1172  ATPase  26.32 
 
 		 374 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  25.95 
 
 		 304 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  28 
 
 		 304 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>