57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1083 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1083  ATPase  100 
 
 
469 aa  957    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  44.54 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  43.89 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  40.13 
 
 
471 aa  348  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  35.11 
 
 
460 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  36.22 
 
 
463 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  35.6 
 
 
458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  33.11 
 
 
464 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  31.91 
 
 
469 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  29.58 
 
 
470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  29.21 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  28.09 
 
 
462 aa  216  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  30.18 
 
 
464 aa  202  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  26.98 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  27.54 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  31.19 
 
 
473 aa  199  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  31.5 
 
 
474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  29.21 
 
 
496 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  31.63 
 
 
431 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  28.6 
 
 
457 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  30.68 
 
 
443 aa  183  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  28.79 
 
 
454 aa  176  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  32.62 
 
 
439 aa  169  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  27.33 
 
 
420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  27.23 
 
 
463 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  28.22 
 
 
462 aa  161  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  24.89 
 
 
456 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  26.97 
 
 
457 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  25.81 
 
 
450 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  31.73 
 
 
439 aa  150  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  26.41 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  25.22 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  26.48 
 
 
478 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  29.38 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  25.16 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  26.86 
 
 
487 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  26.73 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  26.35 
 
 
472 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.66 
 
 
509 aa  113  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  26.1 
 
 
470 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  29.31 
 
 
472 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  27.32 
 
 
480 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  25.68 
 
 
475 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.44 
 
 
474 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  25.96 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  21.8 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  23.91 
 
 
454 aa  82  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  29.07 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  21.51 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1968  hypothetical protein  41.57 
 
 
98 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.249157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  23.33 
 
 
313 aa  67  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  28.27 
 
 
501 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  18.95 
 
 
304 aa  56.6  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  25 
 
 
261 aa  51.6  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  25.86 
 
 
277 aa  47  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  23.44 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1665  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  33.33 
 
 
289 aa  43.1  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>