43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8891 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1002    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  40.48 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  28.45 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  28.12 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  28.08 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  24.63 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  28.48 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.87 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  27.05 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  27.93 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  27.56 
 
 		 464 aa  97.1  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  26.73 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  23.39 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  25.06 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  25.11 
 
 		 478 aa  87.4  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  24.24 
 
 		 464 aa  86.7  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  22.19 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  26.11 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  26.52 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  26.46 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  28.01 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.18 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  22.58 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  20.21 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  26.82 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  20.98 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  24.35 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  25.88 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  26.46 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  29.12 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  23.23 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  23.67 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  21.54 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  27.65 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  28.27 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  22.75 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.72 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3397  hypothetical protein  46.03 
 
 		 79 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  25.62 
 
 		 470 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  26.8 
 
 		 407 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  23.92 
 
 		 472 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  26.63 
 
 		 475 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  25.7 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>