61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1767 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  70.42 
 
 
456 aa  673    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  100 
 
 
456 aa  928    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  56 
 
 
456 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  35.94 
 
 
462 aa  255  9e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  34.7 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  32.47 
 
 
461 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  33.97 
 
 
463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  30.21 
 
 
454 aa  195  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  30.21 
 
 
464 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  30.91 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  30.28 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  31.57 
 
 
473 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  30.67 
 
 
464 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  30.29 
 
 
450 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  30.73 
 
 
443 aa  176  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  30.91 
 
 
476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  28.23 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  27.72 
 
 
460 aa  170  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  29.11 
 
 
463 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  27.71 
 
 
458 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  27.48 
 
 
474 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  29.07 
 
 
407 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  27.05 
 
 
457 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  28.33 
 
 
496 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  31.45 
 
 
431 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  24.89 
 
 
469 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  28.01 
 
 
457 aa  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  26.04 
 
 
460 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  28.17 
 
 
470 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  28.94 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  29.18 
 
 
439 aa  144  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  30.26 
 
 
439 aa  144  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  27.29 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  28.14 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  25.84 
 
 
463 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  30.45 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  26.64 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  25.35 
 
 
487 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  23.94 
 
 
472 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  23.83 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  22.71 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  21.35 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  21.29 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  25.81 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  23.23 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.79 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2379  ATPase  24.78 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  22.46 
 
 
498 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  26.63 
 
 
277 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  25.54 
 
 
279 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0384  ATPase  25 
 
 
361 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.000000176931  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  27.17 
 
 
283 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  21 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  26.49 
 
 
307 aa  53.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1105  hypothetical protein  28.75 
 
 
394 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  24.53 
 
 
356 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  24.66 
 
 
342 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  25.48 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  25.41 
 
 
304 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0177  ATPase  24 
 
 
368 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.335522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  23.33 
 
 
403 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>