52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1193 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1193  ATPase  100 
 
 
457 aa  913    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  41.41 
 
 
443 aa  277  4e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  36.36 
 
 
461 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  36.19 
 
 
469 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  37.05 
 
 
460 aa  258  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  35.04 
 
 
464 aa  246  6.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  36.63 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  35.06 
 
 
470 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  35.37 
 
 
458 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  33.19 
 
 
464 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  32.43 
 
 
454 aa  231  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  31.08 
 
 
463 aa  229  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  34.38 
 
 
474 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  35.18 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  33.41 
 
 
462 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  32 
 
 
496 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  33.33 
 
 
450 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  29.75 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  34.37 
 
 
463 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  33.49 
 
 
464 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  33.01 
 
 
473 aa  206  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  36.09 
 
 
431 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  32.28 
 
 
460 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  32.57 
 
 
463 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  29.61 
 
 
457 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  31.6 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  35.36 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  35.75 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  30.31 
 
 
471 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  26.83 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  30.43 
 
 
478 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  27.05 
 
 
456 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  26.97 
 
 
469 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  29.01 
 
 
509 aa  152  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  25.7 
 
 
456 aa  136  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  29.37 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  28.09 
 
 
472 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  29.98 
 
 
454 aa  106  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  29.23 
 
 
475 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  27.68 
 
 
472 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  24.49 
 
 
476 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  26.91 
 
 
470 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  27.89 
 
 
472 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  30.99 
 
 
407 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  24.16 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.19 
 
 
474 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  24.19 
 
 
480 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  28.06 
 
 
498 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  23.67 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1207  ATPase  23.79 
 
 
408 aa  53.9  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  22.75 
 
 
313 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  36.07 
 
 
105 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>