46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3408 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  100 
 
 
498 aa  968    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  40.48 
 
 
501 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3397  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772983 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  29.65 
 
 
474 aa  133  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  31.52 
 
 
464 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  25.48 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  29.05 
 
 
496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  30.99 
 
 
463 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  31.89 
 
 
460 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  29.79 
 
 
470 aa  124  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  27.94 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  24.95 
 
 
461 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  27.68 
 
 
460 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.05 
 
 
464 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  29.47 
 
 
463 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  25.1 
 
 
473 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  29.81 
 
 
463 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  24.25 
 
 
462 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  29.56 
 
 
464 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  29.93 
 
 
458 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  27.99 
 
 
431 aa  93.2  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  23 
 
 
463 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  27.62 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  25 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  25.27 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  27.03 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  30.43 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  27.98 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  29.07 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  26.3 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  22.09 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  29.01 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  27.44 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  33.51 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  24.37 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  28.82 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  37.43 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  22.46 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  28.49 
 
 
457 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  28.72 
 
 
472 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  23.7 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  23.87 
 
 
462 aa  60.1  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  31.61 
 
 
407 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  28.96 
 
 
472 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  26.41 
 
 
485 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  27.99 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>