60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2329 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  935    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  57.42 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  52.84 
 
 		 475 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  46.49 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  47.77 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  36.71 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  27.6 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  28.85 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.84 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  28.71 
 
 		 450 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  26.04 
 
 		 462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  31.16 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  27.43 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  30.19 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  27.12 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  25.8 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.86 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  30 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  23.58 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  27.99 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  26.77 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  30.19 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  27.53 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  29.82 
 
 		 439 aa  119  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  29.05 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  29.4 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  25.31 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  25.87 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  25.93 
 
 		 496 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  26.03 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  29.62 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0841  hypothetical protein  56.04 
 
 		 101 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  26.35 
 
 		 469 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  26.98 
 
 		 464 aa  113  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  26.15 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  28.09 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  29.79 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  27.8 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  23.94 
 
 		 456 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  26.53 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  24.27 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  21.03 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.92 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  22.02 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  28.48 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  21.28 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  31.31 
 
 		 307 aa  57  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  23.46 
 
 		 407 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  30.83 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.89 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  32.69 
 
 		 261 aa  50.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  27.86 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5448  hypothetical protein  41.25 
 
 		 132 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  24.76 
 
 		 304 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  31.75 
 
 		 105 aa  48.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  25 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  25.7 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  23.49 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  30.77 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  23.55 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>