36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0594 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  100 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  50 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  49.62 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  50.8 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  40.79 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  42.75 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  39.1 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  36.46 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  30.7 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  24.64 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  35.48 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  30.87 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  24.7 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  27.37 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  31.25 
 
 		 431 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  23.5 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  25.48 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  20.88 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  31.01 
 
 		 461 aa  62.4  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  24.32 
 
 		 464 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  31.01 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  25.41 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  24.58 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  27.17 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  27.32 
 
 		 463 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  25.15 
 
 		 471 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  27.17 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  25.9 
 
 		 460 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  27.33 
 
 		 469 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  26.53 
 
 		 456 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  23.56 
 
 		 463 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  34.75 
 
 		 420 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  27.92 
 
 		 454 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  30.77 
 
 		 472 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  25.94 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  22.12 
 
 		 478 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>