49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  100 
 
 
509 aa  1040    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  30.79 
 
 
470 aa  234  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  28.69 
 
 
474 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  28.66 
 
 
458 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  26.85 
 
 
461 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  28.27 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  28.39 
 
 
496 aa  163  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  24.95 
 
 
464 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.03 
 
 
463 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  23.79 
 
 
457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  29.01 
 
 
457 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  29.1 
 
 
464 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  25.76 
 
 
469 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  25.7 
 
 
473 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  22.2 
 
 
462 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  21.8 
 
 
463 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  23.12 
 
 
471 aa  136  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  27.38 
 
 
443 aa  133  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  24.95 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  25.11 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  27.06 
 
 
439 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  24.56 
 
 
464 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  24.31 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  22.6 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.56 
 
 
439 aa  116  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  22.66 
 
 
469 aa  113  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  25 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  22.13 
 
 
450 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  22.41 
 
 
463 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  24.24 
 
 
462 aa  94.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  21.04 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  25.32 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  21.29 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  19.63 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  18.98 
 
 
478 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  21.28 
 
 
485 aa  66.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.76 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  22.09 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  22.34 
 
 
304 aa  58.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  19.09 
 
 
456 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  19.89 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  22.89 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  19.64 
 
 
313 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  23.58 
 
 
454 aa  47.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  30.85 
 
 
407 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  23.11 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  22.44 
 
 
480 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  20.75 
 
 
304 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>