48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  100 
 
 		 474 aa  977    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  36.67 
 
 		 485 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  27.78 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  27.02 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  24.68 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  23.74 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.02 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  25.6 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  26.33 
 
 		 464 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  25.41 
 
 		 464 aa  98.2  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  26.64 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  27.03 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  25.29 
 
 		 460 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  26.51 
 
 		 450 aa  93.6  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  26.44 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  22.25 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  28.32 
 
 		 458 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  24.12 
 
 		 496 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  24.13 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  23.48 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  23.38 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  24 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  23.1 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  27.19 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  26.92 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  25.29 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  24.8 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.21 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  23.81 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  22.79 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  22.13 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  23.21 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  23.92 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  26.08 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.76 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  22.96 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  26.01 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  23.6 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  23.66 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  21.19 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  23.28 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  22.72 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  23.66 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  22.03 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  22.85 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  24.07 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  22.19 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  25 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>