11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1207 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1207  ATPase  100 
 
 
408 aa  813    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1130  ATPase  34.64 
 
 
421 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1105  hypothetical protein  32.78 
 
 
394 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0496  hypothetical protein  29.87 
 
 
383 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  23.79 
 
 
457 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  27.86 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  26.4 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  28.01 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  23.68 
 
 
463 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  24.94 
 
 
457 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  24.75 
 
 
470 aa  46.6  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>