More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0226 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  53.49 
 
 		 673 aa  672    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  95.83 
 
 		 671 aa  1211    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 671 aa  1323    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  62.07 
 
 		 673 aa  779    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  62.61 
 
 		 674 aa  825    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 666 aa  579  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 713 aa  568  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  44.13 
 
 		 677 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  43.81 
 
 		 692 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 697 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 675 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 660 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 655 aa  514  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 696 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 681 aa  507  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 695 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  41.84 
 
 		 685 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 679 aa  498  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 701 aa  492  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 653 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 656 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  38.49 
 
 		 667 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  38.75 
 
 		 667 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  38.49 
 
 		 667 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  38.12 
 
 		 670 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  37.62 
 
 		 672 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  38.26 
 
 		 670 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  37.86 
 
 		 667 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  37.41 
 
 		 702 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 658 aa  423  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 770 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  34.85 
 
 		 660 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 664 aa  405  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  35.16 
 
 		 681 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 649 aa  398  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 702 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 688 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 687 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  34.65 
 
 		 720 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 675 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 671 aa  386  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  34.07 
 
 		 652 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 670 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.15 
 
 		 674 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  34.07 
 
 		 654 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 654 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 		 657 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  34.07 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  34.07 
 
 		 652 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.92 
 
 		 654 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 719 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  34.07 
 
 		 654 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  34.07 
 
 		 654 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  34.07 
 
 		 654 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  34.35 
 
 		 669 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 694 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  33.53 
 
 		 655 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 919 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 919 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 709 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  34.21 
 
 		 662 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  36.5 
 
 		 691 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 920 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 671 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  33.38 
 
 		 669 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  33.38 
 
 		 669 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 690 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 954 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  33.38 
 
 		 669 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.81 
 
 		 715 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  34.5 
 
 		 669 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 702 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  35.73 
 
 		 681 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  33.38 
 
 		 669 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  47.01 
 
 		 1089 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  33.48 
 
 		 700 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 724 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 654 aa  364  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  33.77 
 
 		 686 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 695 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  34.23 
 
 		 708 aa  363  8e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 957 aa  362  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 558 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 691 aa  362  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  38.98 
 
 		 1010 aa  361  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.09 
 
 		 705 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 712 aa  359  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  33.24 
 
 		 717 aa  359  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 701 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1543  two component signalling adaptor domain-containing protein  43.04 
 
 		 468 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.322642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  34.43 
 
 		 715 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 686 aa  357  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 686 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 688 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 694 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  33.61 
 
 		 714 aa  355  1e-96  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>