294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3866 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  100 
 
 		 471 aa  952    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  42.86 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  42.86 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  42.86 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  42.86 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  42.86 
 
 		 486 aa  352  8e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  41.1 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  41.31 
 
 		 488 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  42.64 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.64 
 
 		 486 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  42.64 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  41.1 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  44.79 
 
 		 490 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.33 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  40.7 
 
 		 488 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  40.33 
 
 		 486 aa  346  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  40.54 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  41.1 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  40.54 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.04 
 
 		 490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  42.68 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  39.96 
 
 		 490 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  40.33 
 
 		 486 aa  342  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  40.12 
 
 		 486 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  40.12 
 
 		 486 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  42.28 
 
 		 488 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.33 
 
 		 486 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  40.33 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  42.25 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  42.95 
 
 		 490 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.07 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.07 
 
 		 488 aa  339  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  42.07 
 
 		 488 aa  339  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  42.07 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  41.83 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  42.95 
 
 		 490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  42.95 
 
 		 490 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  45.13 
 
 		 485 aa  339  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  42.95 
 
 		 490 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  42.95 
 
 		 490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.72 
 
 		 488 aa  335  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.69 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  40.5 
 
 		 487 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  40.66 
 
 		 490 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.66 
 
 		 490 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.63 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  37.76 
 
 		 487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  40.59 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.95 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  38.98 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  38.98 
 
 		 490 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  38.98 
 
 		 490 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  38.98 
 
 		 490 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.25 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.51 
 
 		 490 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.92 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  42.73 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  42.51 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  37.79 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.83 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  38.17 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  43.32 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  41.63 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  43.82 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  41.83 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  40.64 
 
 		 492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.59 
 
 		 486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  41.2 
 
 		 496 aa  282  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.87 
 
 		 483 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  39.2 
 
 		 493 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.39 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  36.57 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  38.34 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  44.64 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  41.16 
 
 		 499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  41.22 
 
 		 497 aa  270  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.01 
 
 		 487 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  39.56 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  40.95 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  38.71 
 
 		 491 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.75 
 
 		 493 aa  259  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.32 
 
 		 505 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.65 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.67 
 
 		 509 aa  257  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  40.6 
 
 		 470 aa  255  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.23 
 
 		 491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  39.4 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  40.57 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  40.57 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  40.57 
 
 		 489 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.62 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.62 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  40.33 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  40.33 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  40.33 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  40.33 
 
 		 489 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  36.81 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.23 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>