222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2623 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  100 
 
 		 316 aa  658    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  87.3 
 
 		 316 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  83.17 
 
 		 316 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  62.86 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  62.54 
 
 		 316 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  62.22 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  61.9 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  61.27 
 
 		 317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  59.24 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  53.8 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  55.66 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  55.35 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  55.03 
 
 		 339 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  55.35 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  55.17 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  55.35 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  55.03 
 
 		 339 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  55.35 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  55.66 
 
 		 319 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  55.66 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  55.17 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  54.86 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  54.4 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  55.84 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  55.35 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  55.35 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  53.14 
 
 		 335 aa  351  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  53.14 
 
 		 335 aa  351  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  48.89 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  50.48 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  49.21 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  49.36 
 
 		 321 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  50.16 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  50.16 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  50.16 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  50.16 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  50.16 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  50.16 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  50.16 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  48.78 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  49.53 
 
 		 321 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  47.45 
 
 		 319 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  50.63 
 
 		 319 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  47.17 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  48.58 
 
 		 320 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  47.63 
 
 		 320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.23 
 
 		 319 aa  298  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  54.33 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  43.95 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  43.35 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.49 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  26.12 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.85 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  24.58 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.03 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  28.29 
 
 		 637 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  23.66 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  28.19 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.96 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  26.64 
 
 		 644 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.08 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.15 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  65.22 
 
 		 49 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.51 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  24.22 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  29.94 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  23.85 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  25.94 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>