More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0148 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  587  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  69.04 
 
 		 289 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.63 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  62.2 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  62.2 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  62.2 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  53.12 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  46.32 
 
 		 320 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.13 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.39 
 
 		 293 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  45.23 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  46.4 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  45.65 
 
 		 313 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.33 
 
 		 317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  35.19 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  34.39 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.45 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  33.89 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.86 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  33.92 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  32.39 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  32.75 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  32.86 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.14 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.75 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  33.45 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.07 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  32.06 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.45 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.58 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  31.36 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.49 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.36 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.01 
 
 		 311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  32.85 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.14 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.86 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.57 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31.56 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  31.65 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  30.58 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.67 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  36.55 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.33 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  32.18 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  30.85 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  30.85 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  34.21 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.45 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  31.1 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  32.75 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  30.48 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  29.5 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  32.36 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  27.44 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  29.97 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  30.08 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  29.56 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  30.51 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  28.81 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.6 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.24 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  28.08 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  30.6 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  27.11 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  32.13 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.77 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  28.01 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.56 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  25.86 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  37.7 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  27.86 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  26.33 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30.27 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  30.77 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  30.28 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.19 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  33.97 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  29.68 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  32.87 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  27.11 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.62 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  28.32 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>