92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12800 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1204    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  53.7 
 
 
552 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  53.7 
 
 
414 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5503  ATPase central domain-containing protein  61.84 
 
 
593 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  37.59 
 
 
478 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  35.33 
 
 
418 aa  193  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  38.54 
 
 
639 aa  193  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  37.46 
 
 
771 aa  193  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  35.37 
 
 
388 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  35.37 
 
 
388 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  35.37 
 
 
388 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  36.45 
 
 
330 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  39.22 
 
 
759 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  38.21 
 
 
899 aa  186  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  37.26 
 
 
343 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  39.6 
 
 
698 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  38.83 
 
 
665 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  35.96 
 
 
619 aa  177  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  35.02 
 
 
495 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  34.01 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  34.48 
 
 
405 aa  174  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  33.88 
 
 
362 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  34.33 
 
 
346 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  32.99 
 
 
463 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  33.33 
 
 
455 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.56 
 
 
412 aa  157  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  32.78 
 
 
425 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  31.89 
 
 
416 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  35.03 
 
 
319 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  35.03 
 
 
319 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  35.03 
 
 
319 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  35.6 
 
 
380 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  32.2 
 
 
390 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  30.93 
 
 
475 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  30.93 
 
 
475 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  30.93 
 
 
475 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  30.82 
 
 
453 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  30.2 
 
 
390 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.59 
 
 
532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  29.63 
 
 
1160 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  30.18 
 
 
666 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  29.02 
 
 
926 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  28.62 
 
 
811 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  27.95 
 
 
341 aa  100  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  29.64 
 
 
1519 aa  97.4  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  29.26 
 
 
968 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.42 
 
 
544 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  26.46 
 
 
1132 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13919  hypothetical protein  30.38 
 
 
619 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0831137  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  26.51 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  25.73 
 
 
534 aa  81.6  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11829  hypothetical protein  33.48 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  29.25 
 
 
579 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  22.97 
 
 
617 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25.5 
 
 
494 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.6 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10289  hypothetical protein  27.95 
 
 
631 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000685477  normal  0.631153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0411  ATPase central domain-containing protein  27.83 
 
 
615 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  24.16 
 
 
478 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  22.77 
 
 
542 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  23.21 
 
 
497 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  24.11 
 
 
485 aa  60.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0936  AAA ATPase central domain protein  25.74 
 
 
591 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  25.52 
 
 
474 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0329  ATPase central domain-containing protein  27.11 
 
 
616 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351983  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  21.76 
 
 
586 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  25.36 
 
 
487 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  21.37 
 
 
533 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  24.64 
 
 
397 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.01 
 
 
252 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  28.69 
 
 
387 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0370  AAA ATPase, central region  24.56 
 
 
594 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0380  ATPase central domain-containing protein  24.56 
 
 
594 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0359  ATPase central domain-containing protein  24.56 
 
 
594 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0702866  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  23.35 
 
 
400 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0394  AAA ATPase central domain protein  39.29 
 
 
558 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0521615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  22.75 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  23.35 
 
 
400 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  21.57 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.4 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1557  hypothetical protein  51.22 
 
 
304 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.62 
 
 
412 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5555  AAA ATPase, central region  29.26 
 
 
612 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  21.49 
 
 
392 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5958  ATPase central domain-containing protein  29.26 
 
 
612 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.71 
 
 
395 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  27.19 
 
 
423 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.55 
 
 
659 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.57 
 
 
391 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1247  hypothetical protein  51.22 
 
 
300 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.862412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2947  chromosome partitioning ATPase  42.55 
 
 
294 aa  43.5  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000147107  normal  0.455241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>