47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12043 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  278  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  39.44 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 189 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 182 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  39.53 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  35.9 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 180 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  33.72 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 146 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>