More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0502 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1833  3-dehydroquinate dehydratase  77.08 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21621  3-dehydroquinate dehydratase  74.42 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0724958 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  60.42 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  58.16 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.04 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.75 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 		 156 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 148 aa  169  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.77 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  63.7 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  58.39 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.04 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  63.7 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  58.78 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.44 
 
 		 144 aa  166  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  57.89 
 
 		 153 aa  166  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 149 aa  166  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 146 aa  165  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 146 aa  165  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.79 
 
 		 150 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  63.7 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.56 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.94 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 148 aa  163  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 178 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 146 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>