268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2605 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  73.55 
 
 		 660 aa  890    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 		 616 aa  1013    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  73.31 
 
 		 643 aa  885    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  70.72 
 
 		 669 aa  909    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 637 aa  1281    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  75.82 
 
 		 660 aa  883    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  72.81 
 
 		 625 aa  891    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  53.91 
 
 		 607 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  71.89 
 
 		 702 aa  854    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  75.66 
 
 		 660 aa  879    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  54.03 
 
 		 619 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  74.96 
 
 		 670 aa  905    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  73.71 
 
 		 660 aa  892    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  74.96 
 
 		 673 aa  905    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  73.37 
 
 		 719 aa  868    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  74.18 
 
 		 670 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  70.21 
 
 		 666 aa  867    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  71.61 
 
 		 651 aa  926    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  53.46 
 
 		 569 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  50.33 
 
 		 622 aa  598  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  47.05 
 
 		 598 aa  538  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  50 
 
 		 611 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  50 
 
 		 611 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  47.83 
 
 		 599 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  48.48 
 
 		 599 aa  527  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  47.12 
 
 		 597 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  48.17 
 
 		 602 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  48.32 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  49.26 
 
 		 602 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  49.55 
 
 		 608 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  47.47 
 
 		 601 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  42.32 
 
 		 760 aa  497  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  47.41 
 
 		 601 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.87 
 
 		 763 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  43.33 
 
 		 764 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  45 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  44.1 
 
 		 617 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  47.35 
 
 		 616 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  38.34 
 
 		 852 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  36.44 
 
 		 604 aa  360  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  35.06 
 
 		 606 aa  336  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  34.66 
 
 		 596 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.66 
 
 		 596 aa  328  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  35.4 
 
 		 625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.48 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  34.48 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.3 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.48 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.48 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.32 
 
 		 640 aa  314  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 623 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 584 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  32.79 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 		 652 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 		 607 aa  260  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 		 660 aa  253  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  38.08 
 
 		 641 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 741 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 		 629 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  35.73 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 640 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 		 639 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 		 637 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  36.9 
 
 		 628 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.65 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  32.22 
 
 		 610 aa  217  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  32.19 
 
 		 612 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  39.37 
 
 		 407 aa  203  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  30.42 
 
 		 617 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  38.9 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  30.87 
 
 		 617 aa  181  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.04 
 
 		 399 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.56 
 
 		 630 aa  173  9e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.3 
 
 		 628 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  37.8 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.18 
 
 		 401 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  36.47 
 
 		 401 aa  164  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.96 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  36.83 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.8 
 
 		 414 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.8 
 
 		 414 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.49 
 
 		 414 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  38.62 
 
 		 421 aa  137  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  31.85 
 
 		 620 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.43 
 
 		 597 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 588 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 608 aa  98.2  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.95 
 
 		 596 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.56 
 
 		 478 aa  95.1  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.22 
 
 		 597 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.84 
 
 		 581 aa  92.8  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  25.74 
 
 		 484 aa  92.8  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.89 
 
 		 598 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.26 
 
 		 498 aa  91.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  26.39 
 
 		 610 aa  90.5  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  27.63 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.63 
 
 		 626 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 605 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>