66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0706 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  756    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  34.11 
 
 		 617 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  31.46 
 
 		 539 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  35.66 
 
 		 458 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  31.99 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  31.76 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  32.79 
 
 		 379 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  33.04 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  31.42 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  34.03 
 
 		 650 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  30.33 
 
 		 389 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  29.08 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  36.26 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  33.17 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  27.24 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  35.42 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  34.03 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  29.06 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  29.09 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  25.25 
 
 		 396 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  34.25 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27.08 
 
 		 409 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  33.16 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  29.54 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  31.58 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  28.44 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  30.04 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  30.05 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  30.05 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  29.22 
 
 		 397 aa  92.8  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  30.9 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  29.14 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  27.56 
 
 		 390 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  31.28 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  26.15 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  26.16 
 
 		 390 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  30.53 
 
 		 375 aa  86.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  29.91 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.58 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  32.39 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  32.53 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  32.35 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  26.2 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  29.51 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  23.31 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  31.18 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  30.46 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  30.13 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  30.23 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  30.23 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  27.46 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  24.18 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  34.71 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  28.42 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  25.76 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  25.62 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  28.84 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  27.12 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  34.91 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  40.62 
 
 		 390 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  32.53 
 
 		 194 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  39.68 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  29.29 
 
 		 130 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  39.71 
 
 		 178 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1618  hypothetical protein  27.62 
 
 		 548 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465125  hitchhiker  0.0000786567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>