214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0011 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  100 
 
 		 334 aa  678    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  65.09 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  58.98 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  58.41 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  58.7 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  62.84 
 
 		 354 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  56.89 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  60.53 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  58.11 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  58.04 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  58.11 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  52.73 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  63.53 
 
 		 266 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  57.77 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  31.02 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  27.18 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.53 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.13 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.13 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.72 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  28.23 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  26.07 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  26.07 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.07 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  23.28 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.45 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.87 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.46 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  26.97 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  28.31 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  24.87 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  24.55 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  24.21 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.13 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  24.91 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  24.77 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  27.87 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  25.35 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  23.11 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  24.49 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  29.59 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  29.74 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  27.07 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  22.61 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  28.14 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.44 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  24.27 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  25.81 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  25.13 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  29.23 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.69 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  29.59 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.28 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  22.54 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  25.98 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  23.35 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  22.82 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  22.62 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  24.53 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  23.63 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  27.64 
 
 		 482 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>