225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0008 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0008  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 246 aa  506  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0010  LamB/YcsF family protein  62.03 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0006  LamB/YcsF family protein  58.47 
 
 		 242 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0021  hypothetical protein  51.49 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  50.22 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  47.16 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  44.92 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  46.29 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  47.16 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  48.47 
 
 		 245 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  45.73 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  45.89 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 244 aa  214  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  46.72 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  47.16 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  46.72 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  46.29 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  46.29 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  44.17 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  44.87 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  47.16 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  44.68 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  47.16 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  47.16 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 262 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  44.07 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  44.07 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1098  LamB/YcsF family protein  46.29 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.248626  normal  0.159804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3108  LamB/YcsF family protein  45.41 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316999  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  44.59 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4381  LamB/YcsF family protein  44.54 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2827  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  hitchhiker  0.00875882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  42.26 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  43.28 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  43.4 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  44.02 
 
 		 254 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  43.4 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  43.4 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  42.37 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  42.24 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  43.4 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  44.12 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  41.49 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  42.92 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  41.42 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0545  LamB/YcsF family protein  44.64 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000543397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  40.66 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  41.25 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.15 
 
 		 250 aa  188  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.15 
 
 		 250 aa  188  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  40.66 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  40.25 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  40.42 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  42.5 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1803  LamB/YcsF  42.92 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.372546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  40.59 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  41.91 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.25 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  40.5 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  39 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  43.16 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  40 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  40.6 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  43.16 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  40.08 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  41.03 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  41.99 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>