More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  100 
 
 		 403 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  44.3 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  50.66 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  49.09 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  45.26 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  48.96 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  41.9 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  44.56 
 
 		 393 aa  325  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  48.83 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  45.91 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 391 aa  282  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  40.46 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  39.13 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  38.21 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.76 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  33.98 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  39.57 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  34.07 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  37.2 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  30.57 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  30.31 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  28.83 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.05 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  27.5 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  27.5 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.21 
 
 		 885 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  29.85 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.86 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.37 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  24.63 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.7 
 
 		 408 aa  142  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  25.68 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  27.69 
 
 		 880 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  25.24 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.21 
 
 		 420 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.69 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.05 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.75 
 
 		 444 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  27.64 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.81 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.94 
 
 		 423 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  24.94 
 
 		 420 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  26.12 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.48 
 
 		 896 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  26.26 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.51 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.75 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  28.21 
 
 		 496 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.63 
 
 		 439 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  24.81 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.93 
 
 		 418 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.61 
 
 		 610 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.64 
 
 		 608 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.08 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.01 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  30.89 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.47 
 
 		 434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.35 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.87 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.87 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.39 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  26.96 
 
 		 428 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.42 
 
 		 644 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  24.74 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  26.56 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.91 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  23.61 
 
 		 420 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.22 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.87 
 
 		 630 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.85 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  28.86 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  25.65 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  22.62 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  25.72 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  25.65 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.47 
 
 		 650 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  25.65 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4836  aminotransferase class V  31.18 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0889282  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  21.82 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.5 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  25.65 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.47 
 
 		 666 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_002620  TC0059  aminotransferase, class V  27.34 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.768398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.4 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.54 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  25.65 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  25.39 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.75 
 
 		 604 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  25.39 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  25.39 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  25.39 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.75 
 
 		 604 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.21 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.1 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  21.34 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  28.68 
 
 		 878 aa  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.12 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>