149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1127 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1127  HPP  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  54.64 
 
 
182 aa  191  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  54.64 
 
 
182 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  54.64 
 
 
182 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  54.64 
 
 
182 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  54.1 
 
 
182 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  51.37 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  53.55 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  53.55 
 
 
182 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  53.01 
 
 
182 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  53.01 
 
 
182 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  50.82 
 
 
182 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  44.26 
 
 
186 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  46.45 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  41.53 
 
 
179 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  47.74 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  37.57 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  44.87 
 
 
194 aa  134  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  43.33 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  42.14 
 
 
231 aa  131  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  40.33 
 
 
207 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  41.87 
 
 
202 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  40.78 
 
 
175 aa  121  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  42.5 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  38.46 
 
 
190 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  37.84 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  42.16 
 
 
175 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  40.76 
 
 
176 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  40.76 
 
 
189 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  35.39 
 
 
184 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  35.39 
 
 
184 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  37.23 
 
 
174 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  36.31 
 
 
184 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  37.99 
 
 
184 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  37.99 
 
 
184 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  35.96 
 
 
184 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  35.96 
 
 
184 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  36.56 
 
 
190 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  37.43 
 
 
184 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  38.42 
 
 
164 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  34.08 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  36.9 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  40.51 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  35.75 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  34.78 
 
 
383 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 
325 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  36.3 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  41.67 
 
 
323 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  32.8 
 
 
324 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
379 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  32.3 
 
 
379 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  32.3 
 
 
379 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  29.63 
 
 
379 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  38.38 
 
 
189 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  32.26 
 
 
373 aa  87.8  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  33.76 
 
 
301 aa  87.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  40.77 
 
 
285 aa  84.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
361 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  33.08 
 
 
391 aa  84.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
449 aa  82.4  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00020  conserved hypothetical protein  34.46 
 
 
405 aa  82.4  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05260  conserved hypothetical protein  34.46 
 
 
405 aa  82.4  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.615114  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  31.68 
 
 
376 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  32.06 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  34.52 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  34.38 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  31.07 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  28.27 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  37.16 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02209  HPP family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07010)  33.13 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.21118  normal  0.252152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  29.11 
 
 
378 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  36.15 
 
 
377 aa  77.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  28.85 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  28.24 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  28.24 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  35.56 
 
 
368 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  29.68 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  33.33 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  29.68 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  29.68 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  33.08 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  30.64 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  27.62 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  27.93 
 
 
400 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  29.73 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  27.62 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  28.65 
 
 
420 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  32.89 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  33.72 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  31.78 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  26.79 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  31.01 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  31.58 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  32.68 
 
 
388 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>